Этот форт был создан для оборонительных действий по приказу Николая I в 1838 году. Расположен он на небольшом искусственном островке к югу от острова Котлин. Долгое время он входил в систему обороны Кронштадта, но в конце 19 века утратил своё военное значение.
«Чумным» его называют в связи с тем, что в 19 веке форт был настоящей лабораторией по исследованию чумы. В то время в Китае началась эпидемия, но болезнь быстро добралась и до России, а форт «Император Александр I» было решено выделить для проведения опасных для здоровья опытов, так как сооружение было изолировано от внешнего мира. Связь с Кронштадтом осуществлялась только по телефону, телеграфу и с помощью единственного корабля, названного «Микроб». Внутри форт был разделён на две части: заражённую и не заражённую.
С 2011 года доступны лодочные экскурсии в крепость.
